Container-Systeme
sind für kubische oder zylindrische Bags erhältlich und aus Stahl oder Hartplastik gefertigt. Die Container haben Rollen oder können mithilfe von Gabelstaplern oder Rollwagen transportiert werden. Optional können die Container auch mit Waagen ausgestattet sein. Wenn Bags mit sterilen Flüssigkeiten über größere Strecken transportiert werden müssen, empfehlen sich Transportbehälter, die einen verstell- und fixierbaren Deckel besitzen. Dadurch kann eine Oszillation der Flüssigkeit während des Transports unterdrückt werden 1. Siehe Bag-Handling-Systeme und Lager- und Transport-Systeme.